Q7.財政部的版本在執行上有哪些細節可能發生問題？
除了前述可能出現的人頭、假外資等方法之外，包括眾網友、不同會計師、券商，認為財政部版需釐清的疑問還有：
1.所得計算可以扣除「必要費用」，財政部指包括證交稅、手續費及其他，但券商向大戶、實戶及散戶收取的手續費不同，大戶多數有退佣，券商是否要提供手續費資料，供稅捐單位查核？
2.融資利息、房貸利息（借房貸來玩股票的投資人）或丙種借款，是否可以列入「必要費用」計算？
3.券商若不配合財政部如實提供客戶交易資料，並沒有罰則。
Q8.財政部版本何時會定案？何時開始要報繳證所稅？
財政部版本預計從2013年度起實施，也就是2014年5月報稅時就要繳納。不過元大投顧指出，立法院這個會期到5月底就休會，但行政院版本遲未出爐，若不延長或加開會期，5月底前完成三讀機率低。
此外，考量選民立場、以及目前立委諸公們意見仍多，預期立法院通過的法案「只會比財政部版更鬆」，郭榮芳更直截了當的說，財政部版本一定會再次修改，像行政院長陳冲就表示，個人期所稅傾向不納入課徵的範圍，長期持有由5年縮短為3年。所以什麼時候實施？版本如何？還需要一段折衝期。